期刊论文

Cloning and expression analysis of phenylalanine ammonia-lyase gene inLonicera macranthoides

Zhou, R.-B.

中文

中草药

0253-2670

2019

50

1

178-187

10.7501/j.issn.0253-2670.2019.01.027

国家自然科学基金资助项目(81673546) 国家自然科学基金资助项目(81203007) 中央引导地方科技发展专项资金项目(2017XF5044) 湖南省自然科学基金项目(2017JJ3237) 湖南省教育厅资助科研项目(16B193) 湖南省科技厅重点研发项目(2017SK2124) 湖湘中药资源保护与利用2011协同创新中心(湘教通[2015] 351) 国家中医药管理局中药标准化项目(ZYBZH-Y-HUN-24) 湖南中医药大学中药学一流学科项目(校行科字[2018] 3号)。

本校为第一且通讯机构

目的 克隆灰毡毛忍冬苯丙氨酸解氨酶(LmPAL1)基因全长序列,并进行生物信息学和表达模式分析.方法 提取灰毡毛忍冬花总RNA,通过实时荧光定量PCR (qRT-PCR)和RACE技术克隆LmPAL1基因的全长cDNA序列;运用相关软件对该基因序列进行生物信息学分析;利用qRT-PCR测定灰毡毛忍冬茎、叶和不同花期花中该基因的相对表达量.结果 克隆的LmPAL1基因开放阅读框(ORF)长度为2 145bp,编码714个氨基酸,生物信息学分析预测为亲水性蛋白,定位于叶绿体中,包含PAL shielding结构域(527～641 aa),并且含有PAL/HAL活性中心序列GT兀TASGDLVPLSYIAG(196～212 aa),与其他LmPAL1具有较高的相似度;LmPALl基因qRT-PCR结果显示,...

Objective To clone the full length of LmPAL1 gene and analyze bioinformatics and expression patterns from Lonicera macranthoides. Methods The total RNA of L. macranthoides was extracted. The full-length cDNA sequence of LmPAL1 gene was cloned by RT-PCR and RACE technique; The genome sequence in bioinformatics was analyzed by using the relevant software; The relative expression of the gene in stem, leaf, and different flower period was determined by using real-time PCR. Results The cloned LmPAL1 gene open reading frame (ORF) was 2 145 bp, encodi...