胃癌发病关键基因调控网络构建及其靶向治疗中药活性成分筛选研究

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成果类型：

期刊论文

论文标题(英文)：

Construction of regulatory network of key genes in gastric cancer and screening of active components of traditional Chinese medicine for targeted therapy

作者：

宋厚盼;刘恒铭;仇婧玥;冯瑶;吴嫚婷;...

通讯作者：

Zeng, M.-Y.

作者机构：

湖南中医药大学中医诊断学湖南省重点实验室,湖南长沙410208

湖南中医药大学医学院,湖南长沙410208

湖南中医药大学中医心肺病证辨证与药膳食疗重点研究室,湖南长沙410208

[Zeng M.-Y.] Key Laboratory of TCM Heart and Lung Syndrome Differentiation & Medicated Diet and Dietotherapy, Hunan University of Chinese Medicine, Changsha, 410208, China

[熊萌; Qiu J.-Y.; 喻昶; 宋厚盼; 吴嫚婷] Hunan Provincial Key Laboratory of Diagnostic Research in Chinese Medicine, Hunan University of Chinese Medicine, Changsha, 410208, China, Key Laboratory of TCM Heart and Lung Syndrome Differentiation & Medicated Diet and Dietotherapy, Hunan University of Chinese Medicine, Changsha, 410208, China

通讯机构：

[Zeng, M.-Y.] K

Key Laboratory of TCM Heart and Lung Syndrome Differentiation & Medicated Diet and Dietotherapy, China

语种：

中文

关键词：

胃癌;差异表达基因;生物信息学;中药活性成分;免疫细胞浸润;预后分析;桦木酸;长春新碱;丹参酮

关键词(英文)：

Active components of traditional Chinese medicine;Betulinic acid;Bioinformatics;Differentially expressed genes;Gastric cancer;Immune cell infiltration;Prognosis analysis;Tanshinone;Vincristine

期刊：

中草药

ISSN：

0253-2670

年：

2021

卷：

期：

页码：

6939-6952

DOI：

10.7501/j.issn.0253-2670.2021.22.020

基金类别：

国家自然科学基金青年科学基金项目（81703920）；湖湘青年科技创新人才项目（2021RC3101）；湖南省自然科学基金青年科学基金项目（2019JJ50442）；湖南中医药大学校级科研基金项目（2020XJJJ012）；湖南省教育厅科研一般项目（19C1426）；

机构署名：

本校为第一机构

院系归属：

医学院

中医学院

中医诊断研究所

摘要：

目的通过生物信息学方法分析与胃癌发病密切相关的基因调控网络,探讨其在胃癌预后中的价值,并进一步挖掘靶向治疗胃癌的中药活性成分。方法通过GEO数据库获取GSE103236胃癌芯片数据,对芯片数据进行均一化处理,分析胃癌组织与正常胃组织的差异表达基因（differentially expressed genes,DEGs）;应用Metascape数据库对DEGs进行基因本体论（genetic ontology,GO）和京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）通路分析;通过String数据库构建DEGs蛋白交互作用网络;采用Cytohubba筛选关键基因,分析关键基因表达程度与患者的预后及免疫细胞浸润的相关性;运用CTD数据库...

摘要(英文)：

Objective: To analyze the gene regulatory network closely related to gastric cancer through bioinformatics methods, explore its value in the prognosis of gastric cancer, and further explore the active ingredients of traditional Chinese medicine for targeted therapy of gastric cancer. Methods: GSE103236 gastric cancer chip data was obtained from the GEO database, and the chip data was homogenized to analyze the differentially expressed genes (DEGs) between gastric cancer tissue and normal gastric tissue. The genetic ontology (GO) and Kyoto encyc...

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