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基于生物信息学探索针灸治疗类风湿关节炎关键靶标及候选中药识别 题录

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成果类型:
期刊论文
作者:
李梦雅;陈悦;程宁;游海心;丁长松
作者机构:
湖南中医药大学信息科学与工程学院,长沙 410208
湖南省中医药大数据分析实验室,长沙 410208
[陈悦; 程宁; 游海心; 李梦雅] 湖南中医药大学信息科学与工程学院, 长沙
[丁长松] 湖南中医药大学信息科学与工程学院, 长沙<&wdkj&>湖南省中医药大数据分析实验室, 长沙
语种:
中文
关键词:
针灸疗法;关节炎, 类风湿;靶标;生物信息;中药
期刊:
国际中医中药杂志
ISSN:
1673-4246
年:
2024
卷:
46
期:
06
页码:
764-772
基金类别:
湖南省自然科学基金(2023JJ60124); 湖南省重点研发计划项目(2022SK2014); 湖南省教育厅科学研究重点项目(22A0255); 长沙市自然科学基金(kq2202265);
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
信息科学与工程学院
摘要:
目的根据针灸治疗类风湿关节炎关键靶标, 预测共同治疗类风湿关节炎的相关中药。方法收集文献中针灸治疗类风湿关节炎疾病靶点, 检索GEO数据库获得GSE205962基因芯片, 使用R 4.3.1语言筛选差异表达基因, 构建加权基因共表达网络(WGCNA)。将采集靶点与差异基因取交集, 获得共同靶点, 进行高通量GO功能和KEGG通路富集分析, 使用STRING数据库和Cytoscape 3.9.0软件构建PPI网络, 筛选Hub基因。使用CIBERSORT算法探究类风湿关节炎免疫浸润机制, 运用Coremine Medical数据库进行中药预测。结果共筛选出8个关键靶标(RHOA、JAK1、FYN、LCK、STAT1、STAT3、EGF、GATA3)。免疫浸润分析结果显示, 多种免疫细...
摘要(英文):
Objective:Exploration on the mechanism of acupuncture-targeted therapy for rheumatoid arthritis and identification of candidate Chinese materia medica.Methods:Targets of acupuncture for RA were collected from related literature, and GSE205962 gene chips were obtained from GEO database. The weighted co-expression network (WGCNA) was constructed by screening differentially expressed genes using R 4.3.1. The collection targets were taken to intersect with the differential genes, and the common genes were obtained for high-throughput GO and KEGG en...

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