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大鼠急性心肌梗死血瘀证心肌组织代谢组学的生物信息学分析

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成果类型:
期刊论文
作者:
吴德坤;郑景辉;王铁华;袁肇凯(袁肇凯);张敏州;...
作者机构:
[吴德坤; 郑景辉; 王铁华] 广西中医药大学附属瑞康医院
湖南中医药大学中医诊断研究所
广州中医药大学第二附属医院重症医学科
广西中医药大学第一附属医院
[袁肇凯; 简维雄; 莫莉; 孙贵香] 湖南中医药大学
语种:
中文
关键词:
代谢组学;生物信息学;急性心肌梗死;血瘀证;代谢通路;大鼠
关键词(英文):
bioinfermatics;acute myocardial infarction;blood stasis syndrome;metabolic pathways;rat
期刊:
辽宁中医杂志
ISSN:
1000-1719
年:
2016
卷:
43
期:
3
页码:
630-632
基金类别:
国家自然科学基金(81360535) 广西科学研究与技术开发计划项目(桂科合1347004-26) 中国博士后科学基金特别资助项目(2014T70800) 中国博士后科学基金第57批面上资助项目(2015M572296)
机构署名:
本校为其他机构
院系归属:
中医诊断研究所
摘要:
目的:对大鼠急性心肌梗死血瘀证心肌组织代谢组学进行生物信息学分析。方法:在前期实验得出的代谢谱基础上,采用KEGG数据库进行信号通路分析,用HMDB数据库对代谢产物分子注释、相关的酶或转运蛋白及其相关性质进行分析,met PA网络软件对代谢产物路径进行可视化作图。结果:用Met PA分析的生物代谢通路显示,11个代谢产物参与了24条代谢路径。其中柠檬酸循环(Citrate cycle)、丙酮酸代谢(Pyruvate metabolism)、氨酰-tRNA合成(Aminoacyl-tRNA biosynthesis)、半乳糖代谢(Galactose metabolism)、泛醌等萜醌生物合成(Ubiquinone and other terpenoidquinone biosynthesis)、苯丙氨酸,酪...
摘要(英文):
Objective: To analyze the myocardial tissue metabolicomics pathway in rats with heart blood stasis syndrome of acute myocardial infarction. Methods: Signal pathway analysis was carried on by the KEGG method and molecular metabolite annotation by HMDB. The enzyme or transporter and its related properties were analyzed. The metabolite path visualization was made by using met PA network software. Results: By Met PA analysis of biological metabolism pathway,it showed 11 metabolites,involving24 metabolic pathways. The Citrate cycle,Pyruvate metab...

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