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基于转录组和单细胞测序探讨扶正化瘀片抗肝纤维化的作用机制

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成果类型:
期刊论文
作者:
陆华冠;彭望霞;江丽红;姚强;谢新;...
作者机构:
湖南中医药大学科技创新中心/中药粉体与创新药物省部共建国家重点实验室培育基地
语种:
中文
关键词:
肝纤维化;扶正化瘀片;单细胞测序;转录组学;血小板反应蛋白1
期刊:
中国中药杂志
ISSN:
1001-5302
年:
2024
卷:
CSCD
机构署名:
本校为第一机构
摘要:
旨在通过单细胞、转录组学测序和体内外实验,探讨巨噬细胞极化在扶正化瘀片(FZHY)治疗肝纤维化中的作用。从GEO数据库中获取肝纤维化相关芯片、转录组数据集及单细胞测序数据集,筛选差异基因;运用GeneCards、DisGeNET、NCBI、PharmgKB、TTD和OMIM 6个数据库获取肝纤维化相关基因;从GeneCards数据库中获取巨噬细胞极化相关基因;将上述3个基因集取交集,构建蛋白-蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络,使用Cytoscape软件筛选核心蛋白,并通过单细胞测序对核心蛋白的表达模式进行可视化。使用四氯化碳(carbon tetrachloride,CCl4)构建的肝纤维化小鼠模型,采用苏木精-伊红(...

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