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生物信息学分析缺血性脑卒中的差异表达基因

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成果类型:
期刊论文
作者:
谭玉靓;唐文静;彭伊孟;唐标
作者机构:
湖南中医药大学医学院,湖南长沙410208
[唐文静; 谭玉靓; 唐标; 彭伊孟] 湖南中医药大学
语种:
中文
关键词:
缺血性脑卒中;生物信息学;差异表达基因;富集分析
期刊:
现代预防医学
ISSN:
1003-8507
年:
2020
卷:
47
期:
12
页码:
2228-2232
基金类别:
国家自然科学基金(81503385); 2019年湖南省教育厅科学研究项目优秀青年项目(19B436); 湖南省研究生科研创新项目(CX2018B515); 2018年度湖南中医药大学中西医结合一流学科开放基金项目(2018ZXYJH35);
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
医学院
摘要:
目的 基于生物信息学,对缺血性脑卒中(IS)相关差异表达基因(DEGs)进行分子层面的分析,深入分析IS的发病机制和关键基因.方法 从GEO数据库下载与IS相关的生物基因芯片,基于P值及log |FC|值对GEO原始数据进行筛选,确定DEGs.对DEGs进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,了解DEGs介导的生物过程与代谢通路.利用String在线平台,构建DEGs的蛋白相互作用(PPI)网络.利用cytoscape的cytoHubba软件,找出IS的关键基因.结果 本研究共筛选出110个DEGs.功能和通路富集结果显示,上述基因参与MAPK、NF-kappa B、TNF等多种细胞因子和趋化因子的信号转导通路;共同介导炎症以及免疫应答、细胞凋亡等相关生物过程.P...

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