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基于关键致病基因筛选的肝癌临床预后及中药靶向治疗的生物信息学研究

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成果类型:
期刊论文
作者:
吴佳;吴嫚婷;龙荣;仇婧玥;喻昶;...
作者机构:
湖南中医药大学,,湖南中医药大学医学院
湖南中医药大学,,湖南中医药大学中医学院
[曾梅艳] 湖南中医药大学中医学院
[喻昶; 吴嫚婷; 仇婧玥; 熊萌; 宋厚盼] 湖南中医药大学中医诊断学湖南省重点实验室<&wdkj&>湖南中医药大学中医学院
[吴佳; 龙荣] 湖南中医药大学中医诊断学湖南省重点实验室<&wdkj&>湖南中医药大学医学院
语种:
中文
关键词:
肝癌;关键基因;生物信息学;临床预后;免疫细胞浸润;中药
期刊:
天然产物研究与开发
ISSN:
1001-6880
年:
2022
卷:
34
期:
08
页码:
1415-1429
基金类别:
国家自然科学基金(81703920,82004427); 湖湘青年科技创新人才项目(2021RC3101); 湖南省教育厅科学研究重点项目(21A0240);
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
医学院
中医学院
中医诊断研究所
摘要:
通过生物信息学方法筛选肝癌关键致病基因,探究其表达水平、致病机制、免疫浸润、突变及预后情况,并进一步挖掘潜在的可用于肝癌靶向治疗的中药。通过数据集GSE19665分析正常和肝癌组织的差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs);对DEGs进行GO和KEGG分析,构建DEGs蛋白互作网络并筛选肝癌发病关键基因;对关键基因进行突变、免疫浸润、表达及预后分析;挖掘潜在的治疗肝癌的中药和天然活性成分。筛选得到显著性DEGs 159个,主要涉及免疫、炎症反应,参与p53、mTOR等信号通路;筛选出10个关键基因,CDC20等四个基因在肝癌组织的表达显著升高,高表达组患者的总生存期明显降低;关...

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