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融入异构网络特征的深度学习预测中药靶点

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成果类型:
期刊论文
作者:
黄群富;丁长松
作者机构:
[丁长松] 湖南中医药大学 信息科学与工程学院,长沙410208
[丁长松] 湖南省中医药大数据分析实验室,长沙410208
[黄群富] 湖南中医药大学
语种:
中文
关键词:
中药;靶点预测;异构网络;深度神经网络
期刊:
智能计算机与应用
ISSN:
2095-2163
年:
2023
卷:
13
期:
01
页码:
158-163
基金类别:
2020002:湖南省中医药科研计划重点课题 kq2202265:长沙市自然科学基金项目
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
信息科学与工程学院
摘要:
针对传统预测中药靶点相互作用,忽略了中药、成分、靶点3者之间的潜在联系,导致特征提取不足,模型精度不高的问题,构建中药-成分-靶点3层异构网络.利用重启随机游走、高斯核、信息熵算法提取网络特征,并提出了运用深度神经网络分析中药成分-靶点相互作用的模型TCMIT-DNN.实验结果表明,GBDT、RF、SVM模型使用TCMIT 3层异构网络策略后,分类性能均有所提升.TCMIT-DNN的AUC、F1值、准确率分别为96.0%、89.5%、89.5%,均优于TCMIT-GBDT、TCMIT-RF、TCMIT-SVM分类模型.

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