期刊论文

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重庆医学

1671-8348

2020

49

20

3456-3462

10.3969/j.issn.1671-8348.2020.20.032

81703920:国家自然科学基金 2019JJ50442:湖南省自然科学基金 201780:湖南省中医药局一般项目 2017280:湖南省大学生研究性学习和创新性实验计划 2018XJJJ28:湖南中医药大学校级科研基金项目 201610:青年教师科研项目

本校为第一机构

目的 研究幽门螺旋杆菌(Hp)感染胃黏膜上皮细胞(AGS)的分子作用机制、关键基因靶点及靶向作用于这些关键靶点的化合物.方法 通过美国国立生物技术信息中心(NCBI)的GEO数据库检索Hp感染AGS的基因表达谱芯片;通过R软件对芯片数据进行均一化处理,绘制差异表达基因转录谱火山图和层次聚类热图;采用DAVID对显著性差异表达基因进行GO和KEGG通路富集分析;采用STRING构建显著性差异表达基因蛋白质-蛋白质交互(PPI)网络;采用CytoHubba筛选Hp感染AGS细胞的关键基因靶点;采用CTD搜索可能靶向作用于关键基因靶点相关化合物和药物.结果 从GEO数据库中获得Hp感染健康人AGS细胞的基因表达谱数据集GSE70394,经筛...