期刊论文

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湖南中医药大学学报

1674-070X

2024

44

03

383-394

10.3969/j.issn.1674-070X.2024.03.006

82373992:国家自然科学基金 2021JJ30497:湖南省自然科学基金项目 2021JJ30515:湖南省自然科学基金项目 CARS-21:现代农业产业技术体系 2022CX79:湖南中医药大学研究生创新训练项目 2023CX152:湖南中医药大学研究生创新训练项目 :湖南省一流专业建设点:中药资源与开发 :湖南中医药大学重点学科中药学科(校行发规字号)

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目的 鉴定灰毡毛忍冬Lonicera macranthoides MADS-box家族基因并进行生物信息学分析与表达模式验证,克隆湘蕾型和野生型灰毡毛忍冬MADS-box家族成员CMB1 全长.方法 基于转录组数据,利用在线工具对灰毡毛忍冬MADS-box进行生物信息学分析,并利用qRT-PCR验证MADS-box基因在不同品种中的表达模式,通过RT-PCR、RACE技术克隆湘蕾型和野生型灰毡毛忍冬CMB1基因全长.结果 28个灰毡毛忍冬MADS-box蛋白长度为89～359 aa,碱性蛋白占比85.7%,不稳定蛋白占比96.4%,亲水性蛋白占比 96.4%,均定位于细胞核,均为无跨膜结构的非分泌蛋白.转录组显示,与野生型比较,湘蕾型中 28个MADS-box基因有 17.86%表达下调,MIK...

Objective To identify the MADS-box gene family of Lonicera macranthoides,analyze its bioinformatics,validate the expression patterns,and clone the full-length sequences of CMB1,a member of the MADS-box family of Lonicera macranthoides of Xianglei and wild types.Methods Based on the transcriptome data,the bioinformatics of Lonicera macranthoides MADS-box was analyzed with online tools,the expression patterns of MADS-box genes in different cultivars were verified using qRT-PCR,and the full-length sequences of Lonicera macranthoides CMB1 gene of the Xianglei and wild types were cloned by RT-PCR a...