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养心通脉有效部位方对大鼠骨髓间充质干细胞作用蛋白组学的生物信息学分析

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成果类型:
期刊论文
作者:
郑景辉;袁肇凯;黄龙坚;吴新正;简维雄;...
作者机构:
湖南中医药大学中医诊断研究所
[汤亮; 黄龙坚; 王铁华] 广西中医药大学附属瑞康医院
[吴新正] 湖南省第二人民医院
[黄献平; 简维雄; 郑景辉; 袁肇凯; 刘吉勇; 曾刚] 湖南中医药大学
语种:
中文
关键词:
养心通脉有效部位方;骨髓间充质干细胞;蛋白质组学;生物信息学
关键词(英文):
Active principle region of Yang-Xin Tong-Mai Formula;bone marrow mesenchymal stem cells;proteomics;bioinformatics
期刊:
世界科学技术-中医药现代化
ISSN:
1674-3849
年:
2014
期:
11
页码:
2460-2469
基金类别:
国家自然科学基金会青年项目(81102595):养心通脉有效部位方对BMSCs作用靶点及信号转导通路的研究,负责人:郑景辉; 广西壮族自治区科学技术厅科学研究与技术开发计划项目(桂科合1347004-26):基于系统生物学方法中药复方对BMSCs作用靶点及转导通路的研究,负责人:郑景辉; 广西壮族自治区科学技术厅自然科学基金课题(2013GXNSFAA019126):基于免疫蛋白组学的养心通脉有效部位方对大鼠BMSCs作用靶点和信号转导通路的研究,负责人:郑景辉; 广西壮族自治区教育厅广西高等学校优秀中青年骨干教师培养工程资助(桂教人201316号),负责人:郑景辉;
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
中医诊断研究所
摘要:
目的:对养心通脉有效部位方(apr-YTF)应用于骨髓间充质干细胞(BMSCs)的作用蛋白组学蛋白进行生物信息学分析。方法:根据核素标记相对和绝对定量(iTRAQ)蛋白组学技术确定的apr-YTF对BMSCs作用靶点的差异蛋白,通过DAVID数据库搜索软件结合GO数据库搜索,进行注释和富集度分析, KEGG数据库进行信号转导通路分析;VISANT数据库检索蛋白质相互作用。结果:差异蛋白主要参与102种生物学过程、35种细胞组分、6种分子途径,差异蛋白主要参与3条信号转导通路,这些蛋白在3条信号转导通路上相互发生作用。结论:处于差异蛋白功能交互网中交叉点位置的Presenilin-1、Presenilin-2通过Notch 信号通...
摘要(英文):
This study was aimed to analyze the bioinformatics of proteomics of rat bone marrow mesenchymal stem cells (MSCs) intervened by active principle region of Yang-Xin Tong-Mai Formula (apr-YTF). The latest versions of bioinformatics tools including DAVID (http://david.abcc.ncifcrf.gov/) and GO (http://www.geneontology.org/) were combined to assign a precise function to rat bone marrow MSCs intervened by apr-YTF. KEGG and VISANT were assigned with a precise function to rat bone marrow MSCs intervened by apr-YTF. The results showed that a ...

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